Кафедра інформатики та прикладного програмного забезпечення була організована у 1984 році як кафедра статистики. Першим завідувачем кафедри був доцент А.Ф. Щербак. У 1989 році вона була перейменована у кафедру статистики, економічної інформатики і обчислювальної техніки. Завідувачем було призначено доцента М.І. Деркача. З 1995 року кафедру очолює д.т.н., професор Олександр Семенович Зеленський, який є видатним науковцем та практиком. Більше 30 років він був керівником госпдоговірних тем по розробці інформаційних систем на гірничих підприємствах. Ним опубліковано понад 140 наукових робіт. Його ім’я відоме в Україні та за її межами.

З 2005 по 2012 рр. кафедра готувала магістрів по спеціальності “Економічна кібернетика” за програмою «Інформаційний менеджмент». У зв’язку з цим кафедру статистики, економічної інформатики і обчислювальної техніки було перейменовано в кафедру інформатики та інформаційних технологій.

З 2008 року кафедрою здійснюється підготовка фахівців з розробки програмного забезпечення за напрямом «Програмна інженерія» та спеціальністю “Програмне забезпечення систем”.

З 1 липня 2013 року у зв’язку з об’єднанням вузів кафедра ввійшла до складу факультету інформаційних технологій Криворізького національного університету і була перейменована в кафедру інформатики та прикладного програмного забезпечення.

З 1 лютого 2015 року кафедра інформатики та прикладного програмного забезпечення увійшла до складу обліково-економічного факультету Криворізького економічного інституту.